明清两代外感热病发病率很高，特别是传染性很强的瘟疫多次流行。这类病病情发展迅速，并且变化多端，单依靠《伤寒论》的治法已不能满足需要。这一时代的医家逐渐认识到温热病需要一个不同于伤寒的治疗体系。

刘完素主张用寒凉药物，是温病治疗的先导，明代吴有性的“杂气致病”在病因方面又有新的发明，清代叶桂、吴瑭、薛雪确立了温病、湿温病卫气营血及三焦辨证的规律，至此，温病学才臻于完善，形成了温病学派。

吴有性，字又可。明末姑苏(今江苏吴县)人，生活在16世纪80年代至17世纪60年代。当时明王朝趋于倾覆，农民起义不断发生，战乱饥荒，疫病猖獗。《吴县志》记载当时疫病流行时，“一巷百余家，无一家仅免；一门数十口，无一口仅存者”。但当时的治疗却不越《伤寒论》雷池一步，经医而死者不计其数。在这种情况下，吴有性认识到伤寒与温病是两种病症。根据自己的实践经验，写出了《温疫论》，提出了“杂气致病”。认为天地间不仅风、寒、暑、湿、燥、火六淫邪气，一些传染病是由于杂气所感，而且“杂气为病，更多于六气”，传染性极强的“戾气”(或称疠气)就是杂气的一种。杂气无形、无声、无嗅，但它是一种物质，“一气自成一病”，具体地提出了传染病病因。书中还提出了杂气感人的途径，以及邪留部位和治疗规律。《温疫论》的问世，为后来温病的诊治形成独立的体系创造了条件。

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