当树木开始发芽的时候，列奥纳多和弗兰切斯科整天在果园里和附近的树林里消磨时光，观察植物生命的复苏。画家有时画一棵树或一朵花，努力像画肖像一样捕捉那种生动的相似之处——它那种特殊的，独一无二的风貌，这是任何时候在任何地方都不可能复现。

他向弗兰切斯科讲解道，树的横截面上的圆圈每年增加一个，叫作年轮，因此根据其数目可以知道这棵树的年龄；还可以根据每圈年轮的厚度来判断相应的那一年的降水量，也可以根据年轮的厚度来判断树的长势，年轮朝南的那一部分由于接受阳光多——就厚一些，所以树干的中心经常偏向于树的北侧。

他还讲道，春天的汁液集聚在茎的内部表皮和外壳之间，使茎的质地细密，使茎膨胀并且出现皱褶，在前几年的裂隙中形成新的更深的裂隙，植物的体积这样就增大了。如果把一根枝割断或者划破茎皮，那么生命的医治力量就会把更多的营养成分吸引到患处来，患处得到比其他地方更多的营养，所以后来愈合处的皮就更厚一些。汁液的力量是强大的，达到均衡之后，不能自动停止，超过了患处的需要，便在那里鼓出来——形成节疤赘疣，“犹如沸腾的水上的气泡”。

列奥纳多谈论大自然时，语气平和，甚至冷漠枯燥，只关心科学的明确性。春天的植物本来是生机盎然的，可是他讲起来却不动声色，只注意精确性，好像是谈论死的机器一样：“茎和枝形成的角度越尖锐，枝的年限就越短并且单细。”他把松树和杉树的针叶整齐的锥形排列归结为抽象的数学多面体定理。

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