叶企孙在重庆的日子，值得大书一笔的就是他多次接待了英国学者李约瑟，并与之结下了深厚的友谊。李约瑟当时是英国大使馆的科学参赞，他告诉叶企孙说他想撰写一部《中国科学技术史》。一位外国人要为中国的科技作史，这使叶企孙内心又愧疚又佩服。因此他决计要帮助他，这是其一。其二，经过考察，他发现李约瑟是一位具有科学精神的科学家。李约瑟撰写《中国科学技术史》的深层动机是什么？经过多次交谈，叶企孙得知李约瑟有一个百思不得其解的问题：中国创造了古代科学技术的辉煌，这样的创造力缘何近代却陨落不见？借此线索，用一部科学史查找症结，就是李约瑟写作此书的初衷。英雄所见略同，这个问题叶企孙早年就提出过，并且曾经进行过深入的探讨。经过与李约瑟接触，叶企孙认为李约瑟的科学精神体现在他的动机与出发点上，他不是褊狭的民族主义者，而是站在人类精神的高度去发现问题。他在发现问题之后，用来研究和探讨的方法具有丰富性、多元性的特点，其中包括运用现代科技成果来指导丰富自己的认识论和方法论，同时又能从不同地域的历史文化中获取灵感等等。李约瑟对中国人民怀有深厚的感情，对中国思想与文化有深刻的了解。他热爱中国，却对当时的国民政府非常失望，认为共产党是中国未来的希望。在这一点上，叶企孙非常欣赏李约瑟，认为他是一个正直的受人尊敬的科学家。因此叶企孙竭尽全力支持李约瑟，多方联系图书馆为其查找资料，还把自己收集的科学史资料送给他，并且配上英文以利李约瑟查找。他的这些支持，超过了李约瑟的预想，在叶企孙身上，李约瑟发现了在西方同行身上难以找寻的哲人般的光芒。

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